MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-285

Total Repeats: 4787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020384	ACAAA	2	10	88	97	80 %	0 %	0 %	20 %	452195885
2	NC_020384	A	6	6	95	100	100 %	0 %	0 %	0 %	452195885
3	NC_020384	TCA	2	6	134	139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195885
4	NC_020384	ATTTG	2	10	140	149	20 %	60 %	20 %	0 %	452195885
5	NC_020384	TGC	2	6	199	204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452195885
6	NC_020384	AATA	2	8	330	337	75 %	25 %	0 %	0 %	452195885
7	NC_020384	GTAT	2	8	383	390	25 %	50 %	25 %	0 %	452195886
8	NC_020384	A	6	6	451	456	100 %	0 %	0 %	0 %	452195886
9	NC_020384	ATAA	2	8	481	488	75 %	25 %	0 %	0 %	452195886
10	NC_020384	A	6	6	567	572	100 %	0 %	0 %	0 %	452195886
11	NC_020384	TCT	2	6	641	646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195886
12	NC_020384	TGA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195886
13	NC_020384	GAAA	2	8	840	847	75 %	0 %	25 %	0 %	452195886
14	NC_020384	TGG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452195886
15	NC_020384	ATA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195886
16	NC_020384	GAACA	2	10	1058	1067	60 %	0 %	20 %	20 %	452195886
17	NC_020384	GAA	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195886
18	NC_020384	TCA	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195886
19	NC_020384	AT	3	6	1498	1503	50 %	50 %	0 %	0 %	452195886
20	NC_020384	ACA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195886
21	NC_020384	AGA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195886
22	NC_020384	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	452195886
23	NC_020384	TA	3	6	1661	1666	50 %	50 %	0 %	0 %	452195886
24	NC_020384	GAA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195886
25	NC_020384	CAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195887
26	NC_020384	AAC	2	6	1693	1698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195887
27	NC_020384	TTAAAA	2	12	1712	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195887
28	NC_020384	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195887
29	NC_020384	ATTC	2	8	1841	1848	25 %	50 %	0 %	25 %	452195887
30	NC_020384	AGG	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452195887
31	NC_020384	TGA	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195887
32	NC_020384	TAA	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195887
33	NC_020384	ACA	2	6	1927	1932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195887
34	NC_020384	CAA	2	6	1967	1972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195887
35	NC_020384	GTG	2	6	1998	2003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452195887
36	NC_020384	AGC	3	9	2038	2046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452195887
37	NC_020384	TTATT	2	10	2065	2074	20 %	80 %	0 %	0 %	452195887
38	NC_020384	TTA	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195887
39	NC_020384	TGA	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195887
40	NC_020384	GGA	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452195887
41	NC_020384	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195887
42	NC_020384	GTA	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195887
43	NC_020384	CAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195887
44	NC_020384	GGT	2	6	2359	2364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452195887
45	NC_020384	TGAT	2	8	2416	2423	25 %	50 %	25 %	0 %	452195887
46	NC_020384	CA	4	8	2484	2491	50 %	0 %	0 %	50 %	452195888
47	NC_020384	AAAG	2	8	2519	2526	75 %	0 %	25 %	0 %	452195888
48	NC_020384	TCA	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195888
49	NC_020384	T	6	6	2593	2598	0 %	100 %	0 %	0 %	452195888
50	NC_020384	CTT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195888
51	NC_020384	CATG	2	8	2763	2770	25 %	25 %	25 %	25 %	452195888
52	NC_020384	T	6	6	4897	4902	0 %	100 %	0 %	0 %	452195889
53	NC_020384	TCA	2	6	5051	5056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195889
54	NC_020384	ATT	2	6	5505	5510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195890
55	NC_020384	TCT	2	6	5513	5518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195890
56	NC_020384	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	452195890
57	NC_020384	GAA	2	6	5635	5640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195890
58	NC_020384	ATATC	2	10	5679	5688	40 %	40 %	0 %	20 %	452195890
59	NC_020384	CTA	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195890
60	NC_020384	GAA	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195890
61	NC_020384	GCA	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452195890
62	NC_020384	TAA	2	6	5836	5841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195890
63	NC_020384	ACC	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452195890
64	NC_020384	TTAT	2	8	7257	7264	25 %	75 %	0 %	0 %	452195891
65	NC_020384	GAA	2	6	7287	7292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195891
66	NC_020384	T	7	7	7321	7327	0 %	100 %	0 %	0 %	452195891
67	NC_020384	GT	4	8	7346	7353	0 %	50 %	50 %	0 %	452195891
68	NC_020384	TTTGT	2	10	7359	7368	0 %	80 %	20 %	0 %	452195891
69	NC_020384	TAAT	2	8	7389	7396	50 %	50 %	0 %	0 %	452195891
70	NC_020384	TAA	2	6	7443	7448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195891
71	NC_020384	T	6	6	7482	7487	0 %	100 %	0 %	0 %	452195891
72	NC_020384	T	6	6	7559	7564	0 %	100 %	0 %	0 %	452195891
73	NC_020384	CATA	2	8	7863	7870	50 %	25 %	0 %	25 %	452195892
74	NC_020384	ATT	2	6	7881	7886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195892
75	NC_020384	TTC	2	6	7899	7904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195892
76	NC_020384	T	6	6	7922	7927	0 %	100 %	0 %	0 %	452195892
77	NC_020384	CTTT	2	8	8017	8024	0 %	75 %	0 %	25 %	452195892
78	NC_020384	TGA	2	6	8025	8030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195892
79	NC_020384	CTATT	2	10	8422	8431	20 %	60 %	0 %	20 %	452195893
80	NC_020384	ATT	2	6	8524	8529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195893
81	NC_020384	ATTTT	2	10	8552	8561	20 %	80 %	0 %	0 %	452195893
82	NC_020384	CCA	2	6	8575	8580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452195893
83	NC_020384	ACA	2	6	8654	8659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195893
84	NC_020384	GTT	2	6	8682	8687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452195893
85	NC_020384	TTCG	2	8	8725	8732	0 %	50 %	25 %	25 %	452195893
86	NC_020384	AGT	2	6	8785	8790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195893
87	NC_020384	ATGT	2	8	9203	9210	25 %	50 %	25 %	0 %	452195894
88	NC_020384	T	6	6	9254	9259	0 %	100 %	0 %	0 %	452195894
89	NC_020384	ATC	2	6	9260	9265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195894
90	NC_020384	TTTAC	2	10	9270	9279	20 %	60 %	0 %	20 %	452195894
91	NC_020384	TAA	2	6	10074	10079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195895
92	NC_020384	CTT	2	6	10119	10124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195895
93	NC_020384	TAA	2	6	10150	10155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195895
94	NC_020384	A	6	6	10161	10166	100 %	0 %	0 %	0 %	452195895
95	NC_020384	CTACA	2	10	10175	10184	40 %	20 %	0 %	40 %	452195895
96	NC_020384	TAC	2	6	10195	10200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195895
97	NC_020384	A	7	7	10214	10220	100 %	0 %	0 %	0 %	452195895
98	NC_020384	A	8	8	10225	10232	100 %	0 %	0 %	0 %	452195895
99	NC_020384	TAA	2	6	10252	10257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195895
100	NC_020384	TGT	2	6	10315	10320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452195895
101	NC_020384	GAC	2	6	10514	10519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452195895
102	NC_020384	TAT	2	6	10539	10544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195895
103	NC_020384	TAT	2	6	10659	10664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195895
104	NC_020384	TAA	2	6	10665	10670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195895
105	NC_020384	A	6	6	10669	10674	100 %	0 %	0 %	0 %	452195895
106	NC_020384	ACAT	2	8	10678	10685	50 %	25 %	0 %	25 %	452195895
107	NC_020384	TGTT	2	8	10696	10703	0 %	75 %	25 %	0 %	452195895
108	NC_020384	AT	3	6	10711	10716	50 %	50 %	0 %	0 %	452195895
109	NC_020384	A	6	6	10721	10726	100 %	0 %	0 %	0 %	452195895
110	NC_020384	TAC	2	6	10736	10741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195895
111	NC_020384	ATA	2	6	10785	10790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195895
112	NC_020384	A	6	6	10804	10809	100 %	0 %	0 %	0 %	452195895
113	NC_020384	TAT	2	6	10819	10824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195895
114	NC_020384	ACA	2	6	10848	10853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195895
115	NC_020384	AAAGT	2	10	10878	10887	60 %	20 %	20 %	0 %	452195895
116	NC_020384	GAA	2	6	11037	11042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195895
117	NC_020384	A	6	6	11269	11274	100 %	0 %	0 %	0 %	452195896
118	NC_020384	TAAT	2	8	11290	11297	50 %	50 %	0 %	0 %	452195896
119	NC_020384	AATA	2	8	11313	11320	75 %	25 %	0 %	0 %	452195896
120	NC_020384	ACC	2	6	11342	11347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452195896
121	NC_020384	AAT	2	6	11357	11362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195896
122	NC_020384	CTT	2	6	11822	11827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195897
123	NC_020384	T	7	7	11869	11875	0 %	100 %	0 %	0 %	452195897
124	NC_020384	TTTA	2	8	11898	11905	25 %	75 %	0 %	0 %	452195897
125	NC_020384	GTAA	2	8	11906	11913	50 %	25 %	25 %	0 %	452195897
126	NC_020384	TCT	3	9	11972	11980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195898
127	NC_020384	CTT	2	6	11988	11993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195898
128	NC_020384	A	7	7	12025	12031	100 %	0 %	0 %	0 %	452195898
129	NC_020384	T	6	6	13036	13041	0 %	100 %	0 %	0 %	452195899
130	NC_020384	GT	3	6	13074	13079	0 %	50 %	50 %	0 %	452195899
131	NC_020384	ACA	2	6	13080	13085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195899
132	NC_020384	CAA	2	6	13144	13149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195899
133	NC_020384	TGA	2	6	13337	13342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452195899
134	NC_020384	GTT	2	6	13418	13423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452195899
135	NC_020384	TTC	2	6	13448	13453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195899
136	NC_020384	TCT	2	6	13486	13491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195899
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252	NC_020384	AGAA	2	8	21539	21546	75 %	0 %	25 %	0 %	452195906
253	NC_020384	A	6	6	21545	21550	100 %	0 %	0 %	0 %	452195906
254	NC_020384	AC	3	6	21603	21608	50 %	0 %	0 %	50 %	452195906
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258	NC_020384	A	6	6	21760	21765	100 %	0 %	0 %	0 %	452195906
259	NC_020384	AAG	2	6	21770	21775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452195906
260	NC_020384	AT	3	6	21807	21812	50 %	50 %	0 %	0 %	452195907
261	NC_020384	ACA	2	6	21835	21840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452195907
262	NC_020384	GCA	2	6	21898	21903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452195907
263	NC_020384	TCT	2	6	21958	21963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195907
264	NC_020384	TCAAT	2	10	21971	21980	40 %	40 %	0 %	20 %	452195907
265	NC_020384	AAAG	2	8	22000	22007	75 %	0 %	25 %	0 %	452195907
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398	NC_020384	TAC	2	6	32241	32246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452195918
399	NC_020384	T	6	6	32294	32299	0 %	100 %	0 %	0 %	452195918
400	NC_020384	TTA	2	6	32304	32309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195918
401	NC_020384	AATT	2	8	32312	32319	50 %	50 %	0 %	0 %	452195918
402	NC_020384	TTA	2	6	32325	32330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195918
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427	NC_020384	T	6	6	33120	33125	0 %	100 %	0 %	0 %	452195918
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431	NC_020384	TA	3	6	33407	33412	50 %	50 %	0 %	0 %	452195919
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